Pengelolaan program studi Pendidikan Matematika Universitas Muhammadiyah Purwokerto mengacu sepenuhnya pada struktur organisasi yang ada pada statuta Universitas Muhammadiyah Purwokerto  Tahun 2015 dan SK Rektor Universitas Muhammadiyah Purwokerto Nomor A.17.IV/ 295.1-S.Kep/UMP/VI/2013 tentang Job Deskripsi Tugas Pokok dan Fungsi Pegawai Universitas Muhammadiyah Purwokerto yang jelas.  Kaprodi bertanggung jawab atas pengelolaan dan pelaksanaan program studi kepada Dekan selaku pimpinan Fakultas. Struktur organisasi program studi Pendidikan Matematika Universitas Muhammadiyah Purwokerto dikembangkan mengacu kepada catur dharma perguruan tinggi yang mencakup pendidikan, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat serta pengamalan Al Islam dan Kemuhammadiyahan. Oleh karena itu tugas-tugas di dalam program studi Pendidikan Matematika Universitas Muhammadiyah Purwokerto didistribusikan kepada unit/staf sesuai dengan unsur catur dharma tersebut.
                                                 
GAMBAR STRUKTUR ORGANISASI
PROGRAM STUDI PENDIDIKAN MATEMATIKA UM PURWOKERTO